1988年6月，经北京市机构编制委员会批准，成立北京市计划生育委员会中心计算机室。

1988年8月，北京市机构编制委员会批准，将北京市医学信息中心改名为北京市医院管理研究所，同时保留北京市卫生局医学情报室。北京市医院管理研究所是北京市卫生局为了发展医院管理学科而成立的研究机构，是全国第一家医院管理科研实体。

 1989年8月，北京市卫生局党组决定，在医学情报室的基础上筹建北京市医学情报研究所，同年11月上报机构建制至北京市机构编制委员会。

1994年4月，北京市机构编制委员会批准，将北京市卫生局医学情报室更名为北京市医学情报所。

2002年1月，北京市机构编制委员会办公室批准，将北京市医学情报所更名为北京市卫生局信息中心。

 2003年12月，北京市计划生育委员会中心计算机室更名为北京市人口和计划生育委员会信息中心。